Après avoir trouvé un bateau qui les emmènera loin de Cancale, John, Joséphine et Tape-Autour font voile jusque Soldaris où le capitaine Piboli les attend. En retard au lieu de rendez-vous, les trois comparses se voient obligés de reprendre la mer, en direction de l'Île aux Merveilles où aura lieu le sacrifice de Joséphine. Sur leur chemin, ils essuieront une tempête et s'échoueront sur une île mystérieuse, peuplée de créatures plus étranges les unes que les autres et sur laquelle John devra faire face à son passé. L'île révélera également à Joséphine des bribes de son enfance, lui permettant d'en apprendre davantage sur ses origines. Parvenant à se défaire de l'emprise de l'endroit, John, Joséphine et Tape-Autour pourront enfin reprendre la mer vers l'Île aux Merveilles, y retrouvant enfin le terrible capitaine Piboli, permettant à John de remplir sa mission : lui apporter l'héritière de Lord McAlistair.